Izabella és Nyikoláj esküvőjét démonok zavarják meg, céljuk sokáig ismeretlen, de a játék során elég hamar kiderül, hogy Izabellát akarják, nem a birodalom elfoglalása a céljuk.
Sovereign Agraelt bízza meg Izabella elfogásával, aki látszólag teljesíti is a feladatot, de később urát elárulva, ellene fordul.
Az Inferno kampány Agrael meneküléséről, s megtisztulásáról szól.
A Goldric által kiszabadított Izabella folytatja a háborút a démonok ellen, de Nyikoláj halála megtöri, s elkeserédésében Goldric intelmei ellenére attól sem riad vissza, hogy egy necromanta (Markal) szövetségét elfogadja, aki kétes igéretet tesz: visszahozza Nyikolájt.
Markal nehéz csatákon keresztül verekszi el megát Izabelláig, a necromanták egykori birodalmát varázslók tartják ellenőrzésük alatt, s náluk vannak szétszórva a necromanták ereklyéi, amit a cél érdekében meg kell szerezni.
Cyrus főmágus legyőzése, s a lázadó Goldric börtönbe zárása után Markal teljesíti Izabellának tett igéretét, de nem sok köszönet lesz benne : Nyikoláj élőholt, akit kiszakítottak a harmóniából, nem képes szeretni, gyűlölt urat kell szolgálni.

Ekközben a sötét elfeknél feltűnik egy ismeretlen warlock, Realag, aki miután vezetője lesz a Shadowbrand klánnak, megpróbálja a többi klánt is egyesíteni, aminek eredménye, hogy többnyire a saját fajtája ellen harcol, a sötételf klánok többsége szövetségben áll az általa jól ismert, s gyűlölt démonokkal.
Ennek a kapmánynak is megvan a célja: Realag menti meg Izabellát, s Markalt (akik Nyikoláj újraélesztési szertertására indultak) a démon seregektől.
A pálya végén úgy tűnik a warlock ismét eltűnik a semmiben, de a végső csata előtt találkozunk vele.
(Realagnak nagyon erős pusztítómágiát lehet fejleszteni, seregnek elegendőek a mélységi hidrák, a többi lényt oda lehet adni a szintén semmiből előbukkanó kétesen gyanús állandó segítőjének).

Másik, némileg párhozamosan zajló történet a Sylvan kampány.
Az elfek határvidékein necromanta seregek portyáznak, Findannak kell védelmezni a határvonalat.
Az erősödő nyomás, majd egy váratlanul érkező démon támadás után Findan új feladatot kap: keresse meg, s nyerje el a smaradsárkányok bizalmát, akik egykoron elhagyták az elfeket, nélkülük nincs esély a háborút megnyerni.
Findan hosszú, kalados útra indul, s smaragdsárkányokkal téer haza, de későn: a fővárosuk necromanták kezére került.
Syris Thalla felszabadítására ott a 20 smaragdsárkány, de eddigre már ismernie kell a feltámasztást, különben nagy eséllyel bebukja a pályát - sárkányokon kívül minden lény a városok védelmével lesz elfoglalva természetesen más hősök vezetésével, akik közül Talanar és Dirael a következő pályán is segítik.
Findan legnagyobb csatáit élőholtak ellen vívja, s a legnehezebb ellenfél nem lesz más, mint a régi szövetséges: Nyikoláj.
Nyikoláj több tízezer fős élőholt serege ellen a sötét mágia hasztalan (pedig jó képesség), élőholtak immunisak az elmebefolyásoló varázslatokra.

A különböző szálakon futó cselekmények a hatodik (Academy) kampányban futnak össze.
Az ifjú varázsló, Zehír, nem más, mint Cyrus fia, apját Markal győzte le.
Zehir a necromanták által megszállt területek felszabadításával kezdni tevékenységét.
Idézőmágiája erős, de összességében nem mindíg tűnik elég hatékonynak - márpedig ő fogja vezetni a sereget Izabella ellen a végjátékban, ami valóban monumentális, több ezer főt felvonultató ütközet lesz.
Addig azonban még sokat fejlődik, de a játékosnak már most el kell dönteni, hogy célja lesz-e a mágussal a misztikus mindenttudás elérése (ehhez sajnos a gép jóindulata is szükséges.
A birodalom felszabadítása után Zehir Heaven területen folytatja a harcot a necromanták ellen, ahol bizony jól jön egy olyan szövetséges, akit az emberek inkább elfogadnak, mint egy messziről jött varázslót.
Goldric egy föld alatti börtönben raboskodik, kiszabadítása után szövetséget kötnek.
Nem sokkal később újabb harcossal találjaák magukat szembe, akinek békés a szándéka, hisz közös a céljuk: Findan Nyikoláj legyőzése után Markal nyomában lépett erre a földre.
Markal legyőzése nem különösebben nehéz, a csata után a három hős szövetségben idul tovább, felszabadítani a még megszállt területeket.
Fönt, messze északon két sötét elf állja útjukat, Realag szövetségwet ajánl, Shadya szokásához híven titokzatos (bár annyira azért nem).
A helyőrségek mögötti várban Izabella várakozik, hatalmas sereg élén, vele Zahir fog megküzdene, előtte a helyőrségeket Realag könnyedén szétveri.
Izabella nem lett gonosz, átok és kétségbeesés miatt kényszerből harcolt - meg kell szabadítani az átoktól, megtisztítani a királynőt.
A szertartás azonban kudraccal végződik, Shadyáról lehull a lepel (mi azért nem volt túl vastag), kiderül valófi énje: Biara, aki Sovereign megbízásából követte Agraelt.
A menekülő démonok után szerencsére marad egy kapu, amin a hősök be is lépnek.
Biarát és Sovereign-t is le kell győzni a hősöknek, több menetben mindegyik hős (Zehír, Goldric, Findan, Realag) harcba száll.

S, hogy mindennek mi volt az oka, mi volt Sovereign célja?
Izabella királynő már születésekor kiválasztott lett, ő hozza világra a főgonoszt - ezért törtek rá az esküvője napján. (elcsépelt történet, de nem baj)
Agrael, illetve Realag szerepe is egyszerű (mondhatnánk bugyuta): Izabella figyelése volt a feladata, s az évek múlásával bele szeretett, elhatározta, nem lesz Sovereign-é a lány.

A kiegészítők kapcsolódnak az alapjátékhoz, de nem a történet azonnali folytatásai, feltűnnek ismerős szereplők, míg másokról csak híreket hallhatunk, s természetesen újabb karaktereket ismerhetünk meg