Roberto Orci előbb a Star Trek 3 rendezői, majd az írói posztját is elveszítette.

Nem tudni, hogy melyik volt előbb, a tyúk vagy a tojás, azaz vajon az új rendező, Justin Lin érkezése miatt írnak új forgatókönyvet a harmadik "újkori" Star Trek-mozifilmnek, vagy Roberto Orci eleve azért vesztette el rendezői megbízatását, mert a szkriptjét végül megvétózta a Paramount stúdió vezetősége. A végeredményt tekintve az okok másodlagosak, a lényeg az, hogy mostantól nem Orci szkriptje alapján készült a Sötétségben: Star Trek folytatása, s ezt maga a filmes erősítette a TrekMovie üzenőfalán, mondván, hogy most már csak produceri rangban van a film mellett - többé-kevésbé.

A távozás körülményeiről, illetve az utód személyéről nem esett szó, azt azonban Orci elmondta, hogy nem tudja megnyugtatni a rajongóit a Star Trek 3 kapcsán, bár bojkottra sem szólítana fel senkit, mert a jelenleg tárgyalt történet is nagyszerűnek ígérkezik - kérdés, hogy a stúdió rábólint-e. Orci egyébként még azt is elárulta a Star Trek-hívőknek, hogy az új széria történetének alakulásáért nem J.J. Abrams produkciós cége, a Bad Robot a felelős, hanem csakis ő, az ő ötlete volt az alternatív idősík, abból a célból, hogy ne lehessen előre tudni, hogy mi fog történni a későbbiekben.