TIM vagy a Cerberus (még nem tudni) meg fogja akarna gyilkolni Shepardot. Valószínűleg ez akkor lesz így, ha elpusztítottad a Collector bázist. Vagy lehet, hogy pont ha meghagytad, TIM-et indoktrinálta a bázis Reaper technológiája, és azért. Mindenesetre nem tudni a részleteket, csak annyit, hogy lesz a harmadik részben olyan is, hogy TIM/Cerberus Shepardot el akarja tenni láb alól.