Nem csak a Xenomorph jelent kihívást az Alien: Isolation világában, viszont senkit nem kell megölnünk benne.

A Creative Assembly elmondása szerint nem csupán a Xenomorph jelent majd veszélyt az Alien: Isolation világában. A fejlesztők ugyanis rengeteg egyéb veszélyforrást rejtettek el a pályákon. Megvadult emberek, hibásan működő droidok keserítik meg az életünket, ám mi egyetlen gyilkosság nélkül letudhatjuk az egész sztorit. Az azonban nem derült ki, hogy a Ripley-család legfőbb nemezise, a Xenomorph is megússza élve vagy vele mindenképpen össze kell csapnunk.

A sztori hőse Ripley lánya, Amanda lesz, aki szeretné kideríteni, mi is történt az édesanyjával és ezért belép a Weyland-Yutani céghez, elutazik a távoli Sevastopolra és megpróbálja megszerezni a USCSS Nostromo fekete dobozát. Azonban hamarosan első kézből tapasztalja meg, milyen ha a szembekerül a család legnagyobb ellenségével.