2401
teszt
-
#1592 Ma voltam érte...
-
#1591 -
#1590 -
#1589 -
#1588 -
#1587 link -
#1586 -
#1585 -
#1584 -
#1583 elkészültek a képek (:
mindent MOE-al csináltam, direkt az 1LBT.pdb-ből, hogy bemutassam a lipáz működésének modelljét.
1. A megnyitott pdb fájl a két enzimmel, amint említettem:
2. A jobb oldali enzim kitörlése után, és a T80-as beszínezett szubsztrát az aktív centrumban.
3. Az fehérje megjelenítését átváltottam; az aktív centrum közelebbről, H-ek hozzáadása után (ezt nem tartalmazza a pdb, mert a felbontása túl kicsi volt a szerkezetfeloldásnál), valamint a két fontos szerpet játszó oldallánc, a 105-ös szerint (SER_105) és a 224-es hisztidint (HIS_204) megjelöltem
4. A fölösleges H-eket elrejtettem a láthatóság kedvéért, bejelöltem 2 távolságot
5. A katalízis első lépéseinek eredménye, a Ser nukleofilizálása a His által, majd a nukleofil támadás a szubsztrátra
6. Optimalizáltam a Ser körüli részt, főképp a kötéstávolságok miatt, bejelöltem a következő lépést.
7. Az alkohol termék létrejötte
Az ezután következő lépés az OH kidiffundálása és egy H2O molekula elhidrolizálja a szubsztrát enzim komplexet és kialakulnak a termékek, valamint az alapállapotú enzim.
Szerintem ezen a példán is nagyon jól látszik az enzimek szerepe, hogy csökkentsék az aktiválási gátat, az által, hogy "beágyaznak" a közti állapotoknak, így kedvezőbbek lesznek a lépések.
remélem tetszett (:
-
#1582 -
#1581 -
#1580 -
IXEMGabeo #1579
-
#1578 -
#1577
asd -
p4x #1576 -
koolermaster #1575 -
milo04 #1574 dd -
#1573
-
Speedi 01 #1572 -
p4x #1571 -
#1570 asd
-
#1569 BE
BE
BE
-
#1568 -
#1567 -
#1566 -
#1565 -
#1564 -
#1563 <object height="81" width="100%"> <param name="movie" value="http://player.soundcloud.com/player.swf?url=http%3A%2F%2Fapi.soundcloud.com%2Ftracks%2F4448275&show_comments=true&auto_play=false&color=ff7700"></param> <param name="allowscriptaccess" value="always"></param> <embed allowscriptaccess="always" height="81" src="http://player.soundcloud.com/player.swf?url=http%3A%2F%2Fapi.soundcloud.com%2Ftracks%2F4448275&show_comments=true&auto_play=false&color=ff7700" type="application/x-shockwave-flash" width="100%"></embed> </object> <span><a href="http://soundcloud.com/italofun64/federico-romanzi-modern-italo-disco">Federico Romanzi - Modern Italo Disco</a> by <a href="http://soundcloud.com/italofun64">Italofun64</a></span> -
#1562 -
interdit #1561 -
interdit #1560 -
#1559 ésígy -
#1558 mittettem-
-
#1557 -
#1556 -
#1555 asd -
Ferenc4 #1554 -
Nelson85 #1553 u mad?