2401
teszt
  • Béluska74
    #1592
    Ma voltam érte...



  • Béluska74
    #1591
  • HanniBél
    #1590
  • tviktor91
    #1589
  • Black Ghost
    #1588
  • Black Ghost
    #1587
    link
  • Black Ghost
    #1586
  • Adaaam
    #1585
  • Adaaam
    #1584
  • TommyC
    #1583
    elkészültek a képek (:
    mindent MOE-al csináltam, direkt az 1LBT.pdb-ből, hogy bemutassam a lipáz működésének modelljét.

    1. A megnyitott pdb fájl a két enzimmel, amint említettem:




    2. A jobb oldali enzim kitörlése után, és a T80-as beszínezett szubsztrát az aktív centrumban.




    3. Az fehérje megjelenítését átváltottam; az aktív centrum közelebbről, H-ek hozzáadása után (ezt nem tartalmazza a pdb, mert a felbontása túl kicsi volt a szerkezetfeloldásnál), valamint a két fontos szerpet játszó oldallánc, a 105-ös szerint (SER_105) és a 224-es hisztidint (HIS_204) megjelöltem




    4. A fölösleges H-eket elrejtettem a láthatóság kedvéért, bejelöltem 2 távolságot




    5. A katalízis első lépéseinek eredménye, a Ser nukleofilizálása a His által, majd a nukleofil támadás a szubsztrátra




    6. Optimalizáltam a Ser körüli részt, főképp a kötéstávolságok miatt, bejelöltem a következő lépést.




    7. Az alkohol termék létrejötte




    Az ezután következő lépés az OH kidiffundálása és egy H2O molekula elhidrolizálja a szubsztrát enzim komplexet és kialakulnak a termékek, valamint az alapállapotú enzim.
    Szerintem ezen a példán is nagyon jól látszik az enzimek szerepe, hogy csökkentsék az aktiválási gátat, az által, hogy "beágyaznak" a közti állapotoknak, így kedvezőbbek lesznek a lépések.


    remélem tetszett (:

  • TommyC
    #1582
  • Black Ghost
    #1581
  • Black Ghost
    #1580
  • IXEMGabeo
    #1579




  • Black Ghost
    #1578
  • FalseHeLL
    #1577

    asd
  • p4x
    #1576
  • koolermaster
    #1575
  • milo04
    #1574
    dd
  • FalseHeLL
    #1573


  • Speedi 01
    #1572
  • p4x
    #1571
  • FalseHeLL
    #1570
    asd
  • Ruley
    #1569
    BE
    BE
    BE
  • Black Ghost
    #1568
  • donbig
    #1567
  • donbig
    #1566
  • donbig
    #1565
  • donbig
    #1564
  • donbig
    #1563
    <object height="81" width="100%"> <param name="movie" value="http://player.soundcloud.com/player.swf?url=http%3A%2F%2Fapi.soundcloud.com%2Ftracks%2F4448275&show_comments=true&auto_play=false&color=ff7700"></param> <param name="allowscriptaccess" value="always"></param> <embed allowscriptaccess="always" height="81" src="http://player.soundcloud.com/player.swf?url=http%3A%2F%2Fapi.soundcloud.com%2Ftracks%2F4448275&show_comments=true&auto_play=false&color=ff7700" type="application/x-shockwave-flash" width="100%"></embed> </object> <span><a href="http://soundcloud.com/italofun64/federico-romanzi-modern-italo-disco">Federico Romanzi - Modern Italo Disco</a> by <a href="http://soundcloud.com/italofun64">Italofun64</a></span>
  • donbig
    #1562
  • interdit
    #1561
  • interdit
    #1560
  • rhazid
    #1559
    ésígy<img data-original="http://www.sg.hu/forumkepek/2011_03/troll.jpeg" class="bb-img lazy" />
  • rhazid
    #1558
    mittettem-
    <img data-original="http://www.sg.hu/forumkepek/2011_03/troll.jpeg" class="bb-img lazy" />
  • rhazid
    #1557
  • RS
    #1556
  • FalseHeLL
    #1555
    asd
  • Ferenc4
    #1554
  • Nelson85
    #1553
    u mad?